Cerkiew pod wezwaniem Przeczystej Bogurodzicy od sześciu stuleci jest soborem – główną świątynią prawosławną na Litwie.
Prawdopodobnie cerkiew Bogurodzicy ufundowała księżna Julianna – żona Wielkiego Księcia Litewskiego Olgierda i matka Jagiełły.
Legenda głosi, że pierwszą cerkiew w tym miejscu wzniósł Wielki Książę Olgierd. Było to około roku 1346. Najstarsze fragmenty murów, jakie się do dziś zachowały, sięgają XV wieku. W XVI stuleciu cerkiew przebudował książę Konstanty Ostrogski.

Przez dłuższy okres cerkiew nie była remontowana. Dwa stulecia temu została przekazana do gestii Uniwersytetu Wileńskiego. Została tu założona biblioteka, powstały audytoria, muzeum i wydział patologii, gdzie dokonywano sekcji zwłok. Aktualny wygląd cerkiew zyskała po przebudowie w połowie XIX wieku, odkąd znów zaczęła służyć wyznawcom prawosławia.