Kiedy lata, skrzydła ma uniesione do góry, na kształt płytkiego V. Zazwyczaj przelatuje do kilku metrów nad miejscami o niskiej roślinności.
Błotniak zasiedla trzcinowiska, torfowiska z zaroślami wierzbowymi, szuwary nad oczkami wodnymi, unika zaś lasów. Po okresie lęgowym żeruje nad polami uprawnymi.
Błotniaki wiją swoje gniazda zazwyczaj w gęstych trzcinach, ponad lustrem wody. Lubi też osiedlać się w turzycowiskach, gdzie mają pod dostatkiem pożywienia. W ostatnich latach coraz częściej błotniaki lęgną się na polach rzepaku i na łąkach. Błotniak jest jedynym ptakiem drapieżnym, który zakłada gniazda w trzcinach.
Błotniaki raz do roku składają od 3 do 5 białawych, lub niebieskawych jaj. Wysiadywane są one przez około 35 dni przez samicę. W okresie lęgowym błotniaki polują na młode ptaki, pisklęta i jaja. Pisklęta opuszczają gniazdo po około 40 dniach, kiedy zaczynają latać, a po 3 tygodniach od wyfrunięcia z gniazda są w pełni samodzielne.https://natura.wm.pl/zwierzeta/86/Blotniak-stawowy